První série
- Atlantská expedice vedená Dr. Weirovou, přijíždí do ztraceného města Antiků
- hned se však nacházejí v zoufalé situaci, která je nutí urychleně najít nové spojence
- spojence najdou v Athosianech
- avšak v zápětí najdou i největší nepřátelé v galaxii
- odříznuti od Země musí členové expedice přežít v nové galaxii
- odhalují tajemství antické technologie a možnosti jak zníčit Wraithy
- Major Sheppard složí tým jenž se skládá z něj, Dr. McKaye, Poručíka Aidena Forda a vůdkyně Athosiánů Teyly Emmagan
- z jedné jejich první mise si vytvoří další nepřátele v Genniích
- série končí dramatickým okamžikem, a to s Atlantidou pod útokem tří wraithských mateřských lodí