První série

 

- Atlantská expedice vedená Dr. Weirovou, přijíždí do ztraceného města Antiků

- hned se však nacházejí v zoufalé situaci, která je nutí urychleně najít nové spojence

- spojence najdou v Athosianech

- avšak v zápětí najdou i největší nepřátelé v galaxii

- odříznuti od Země musí členové expedice přežít v nové galaxii

- odhalují tajemství antické technologie a možnosti jak zníčit Wraithy

- Major Sheppard složí tým jenž se skládá z něj, Dr. McKaye, Poručíka Aidena Forda a vůdkyně Athosiánů Teyly Emmagan

- z jedné jejich první mise si vytvoří další nepřátele v Genniích 

- série končí dramatickým okamžikem, a to s Atlantidou pod útokem tří wraithských mateřských lodí